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設備檢查：在使用前，檢查組織包埋機的各項功能，包括溫度控制、加熱板、冷卻裝置等，確保設備正常運行。

材料準備：準備好所需的材料，包括石蠟、組織樣本、包埋模具、切片刀等。

固定：將取出的組織樣本放入固定液（如福爾馬林）中，固定時間一般為24小時，具體時間根據組織大小和類型而定。

脫水：將固定后的組織樣本依次浸泡在不同濃度的酒精溶液中（如70%、80%、90%、100%），每個濃度浸泡時間一般為1小時，以去除組織中的水分。

透明化：將脫水后的樣本放入透明劑（如二甲苯）中，通常浸泡2-3次，每次30分鐘，以去除酒精并使組織透明。

熔化石蠟：將石蠟加熱至熔化狀態(tài)，溫度一般在60℃左右。

浸泡：將透明化后的組織樣本放入熔化的石蠟中，浸泡30分鐘，確保組織完全被石蠟滲透。

模具準備：準備包埋模具，通常使用塑料或金屬模具，底部涂上一層石蠟以防粘連。

包埋：將浸泡過的組織樣本放入模具中，倒入熔化的石蠟，確保樣本完全被石蠟覆蓋。可以輕輕敲打模具，去除氣泡。

冷卻：將模具放在冷卻板上，待石蠟凝固后取出。

切片機準備：將包埋好的石蠟塊放入切片機中，調整切片厚度（一般為4-5微米）。

切片：使用切片刀進行切割，確保切片均勻、完整。

貼片：將切好的切片貼在玻璃載玻片上，通常使用溫水或粘合劑。

染色：根據需要進行組織切片的染色（如HE染色、免疫組化染色等）。

觀察：在顯微鏡下觀察切片，進行病理診斷或研究。